RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	FAM20A	Q96MK3	541 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MYADM	Q96S97	322 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	HINFP	Q9BQA5	517 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MARCH5	Q9NX47	278 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	CA14	Q9ULX7	337 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688		R4GN57	208 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ARL5C	A6NH57	179 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TBX3	O15119	743 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TGM5	O43548	720 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RFPL2	O75678	378 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZMYND10	O75800	440 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DEXI	O95424	95 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MAGEA9	P43362	315 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PTEN	P60484	403 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PFKP	Q01813	784 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PRKCQ	Q04759	706 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	HTR4	Q13639	388 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TFDP1	Q14186	410 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SPECC1	Q5M775	1068 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PDXDC1	Q6P996	788 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	LILRA6	Q6PI73	481 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MTSS1L	Q765P7	747 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RTL10	Q7L3V2	364 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FERMT3	Q86UX7	667 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	BLID	Q8IZY5	108 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RNF149	Q8NC42	400 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PJA1	Q8NG27	643 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GJA10	Q969M2	543 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TMX3	Q96JJ7	454 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GAD1	Q99259	594 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NELL2	Q99435	816 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	BCO2	Q9BYV7	579 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	CSRNP2	Q9H175	543 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	IPP	Q9Y573	584 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	EVPL	Q92817	2033 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MYO10	Q9HD67	2058 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FAM186A	A6NE01	2351 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688		M0R2N6	131 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SPTLC1	O15269	473 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NCAM2	O15394	837 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TSPAN1	O60635	241 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TADA2A	O75478	443 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	CDKL5	O76039	1030 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TDP2	O95551	362 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SPATA31D3	P0C874	917 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FSHR	P23945	695 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	HOXA9	P31269	272 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MLH1	P40692	756 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NPEPPS	P55786	919 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GRIK3	Q13003	919 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	EPHA7	Q15375	998 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	UVSSA	Q2YD98	709 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FUT10	Q6P4F1	479 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PALB2	Q86YC2	1186 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TMEM143	Q96AN5	459 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MTR	Q99707	1265 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		7.61	□□□□□ -1.19

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