RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222		A0A087WZ62	844 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	NRP1	O14786	923 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	LILRB5	O75023	590 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	CYP3A7	P24462	503 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	ZNF76	P36508	570 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	NEK8	Q86SG6	692 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MAP7D2	Q96T17	732 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	EPC1	Q9H2F5	836 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	SHISA7	A6NL88	538 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	SPTLC1	O15269	473 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP8	P85298	464 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MCTP1	Q6DN14	999 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	POTEH	Q6S545	545 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	LENG9	Q96B70	501 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MBOAT7	Q96N66	472 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	KXD1	Q9BQD3	176 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	BCO2	Q9BYV7	579 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		15.4	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	FRY	Q5TBA9	3013 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	TGM5	O43548	720 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	TDP2	O95551	362 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	GLUD1	P00367	558 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	FZD5	Q13467	585 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222		Q4G0T1	1027 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	STAM	Q92783	540 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	NELL1	Q92832	810 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		15.39	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	STX6	O43752	255 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	MTAP	Q13126	283 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PRR16	Q569H4	304 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ITFG1	Q8TB96	612 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	MIOS	Q9NXC5	875 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	DACT1	Q9NYF0	836 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	MTMR6	Q9Y217	621 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		15.38	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ATRX	P46100	2492 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	WNT7A	O00755	349 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SLC30A4	O14863	429 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	MAGEB2	O15479	319 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SOD2	P04179	222 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ALDH2	P05091	517 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	UROD	P06132	367 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SDHB	P21912	280 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	FSHR	P23945	695 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	TRAPPC10	P48553	1259 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PRKCE	Q02156	737 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	DMWD	Q09019	674 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	RNF39	Q9H2S5	420 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SAMM50	Q9Y512	469 aa		15.37	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	MSH4	O15457	936 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	CHMP2A	O43633	222 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SLC37A4	O43826	429 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	OAT	P04181	439 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ADH1A	P07327	375 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	TMOD1	P28289	359 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	OR1G1	P47890	313 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05

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