RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 STOML1Q9UBI4 398 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PARP2Q9UGN5 583 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DAPK3O43293 454 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 AKR1B10O60218 316 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 IGHDP01880 384 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 MTERF2Q49AM1 385 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 BOLA3Q53S33 107 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TIPINQ9BVW5 301 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 STAP2Q9UGK3 403 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 ABLIM1O14639 778 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 STRNO43815 780 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 IFNA8P32881 189 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF165P49910 485 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ITPK1Q13572 414 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ALX1Q15699 326 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TERB1Q8NA31 727 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SNX25Q9H3E2 840 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 ABCC6O95255 1503 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 ATP5HO75947 161 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KRT19P08727 400 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CDC25BP30305 580 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF132P52740 706 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 VSIG1Q86XK7 387 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PALD1Q9ULE6 856 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 BIRC5O15392 142 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 RUNX1T1Q06455 604 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NCLNQ969V3 563 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TRAF5O00463 557 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 HPS1Q92902 700 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 HPS3Q969F9 1004 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 AGAP3Q96P47 875 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MTA2O94776 668 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINB4P48594 390 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 AMPD2Q01433 879 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RALGDSQ12967 914 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KRT71Q3SY84 523 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SDE2Q6IQ49 451 aa6.69□□□□□ -1.34
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