RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 ARID2Q68CP9 1835 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 MEIS3P2A8K0S8 358 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 LAD1O00515 517 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 B4GALT3O60512 393 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 PAPLNO95428 1278 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 CNPP09543 421 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 ATP2B1P20020 1258 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 SLC11A1P49279 550 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 ZNF174Q15697 407 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 CYP26C1Q6V0L0 522 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 ZNF280BQ86YH2 543 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 SIX5Q8N196 739 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 RNF149Q8NC42 400 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 ERMNQ8TAM6 284 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 NACC1Q96RE7 527 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 CEP250Q9BV73 2442 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 FANCMQ8IYD8 2048 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 DOCK8Q8NF50 2099 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 MED24O75448 989 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 KLRC2P26717 231 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 AXLP30530 894 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 TFDP1Q14186 410 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 IGSF22Q8N9C0 903 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 PIGOQ8TEQ8 1089 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 PGBD4Q96DM1 585 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 CCDC51Q96ER9 411 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 TMEM175Q9BSA9 504 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 FBXL21Q9UKT6 434 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 STK24Q9Y6E0 443 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-221ENST00000550734 KRBA1A5PL33 1030 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 NARSO43776 548 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 DDHD2O94830 711 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 EFEMP2O95967 443 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 LMNAP02545 664 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 ALDH2P05091 517 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 PRPHP41219 470 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 LONRF3Q496Y0 759 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 UBXN11Q5T124 520 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 AGMOQ6ZNB7 445 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 CNNM3Q8NE01 707 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 MCPH1Q8NEM0 835 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 NXPE3Q969Y0 559 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 EPS15L1Q9UBC2 864 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 INPPL1O15357 1258 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 C1RP00736 705 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 SOD2P04179 222 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 NCLP19338 710 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 GLRA2P23416 452 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 PTGDRQ13258 359 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 CAPSQ13938 189 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 AMHR2Q16671 573 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 RILPL1Q5EBL4 403 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 HAUS3Q68CZ6 603 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 SLC44A3Q8N4M1 653 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 URGCPQ8TCY9 931 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 ASAP3Q8TDY4 903 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 RAB34Q9BZG1 259 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 GBP3Q9H0R5 595 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 KANSL3Q9P2N6 904 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 FAN1Q9Y2M0 1017 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 NRP1O14786 923 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 TSPAN1O60635 241 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 CFHP08603 1231 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 CYP11B2P19099 503 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 GJB2P29033 226 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 MBTD1Q05BQ5 628 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 FAM187BQ17R55 369 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 NOTUMQ6P988 496 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 PADI6Q6TGC4 694 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms