RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
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PTPRR-209ENST00000549308 GTF2H1P32780 548 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 APBA1Q02410 837 aa13.1□□□□□ -0.31
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