RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CYP2C9P11712 490 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 STMN1P16949 149 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SERPINB4P48594 390 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CASP7P55210 303 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 APBA1Q02410 837 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ACY1Q03154 408 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 RBL2Q08999 1139 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 MYO1EQ12965 1108 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 DRP2Q13474 957 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CASP8Q14790 479 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 CIB1Q99828 191 aa6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 HIP1O00291 1037 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SIN3BO75182 1162 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 FAM71BQ8TC56 605 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ATL1Q8WXF7 558 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 SNX25Q9H3E2 840 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-225ENST00000541295 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 AOX1Q06278 1338 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 NRAPQ86VF7 1730 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-225ENST00000541295 PAPPAQ13219 1627 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.59□□□□□ -1.36
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