RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 KLK14Q9P0G3 267 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 STK39Q9UEW8 545 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 CCDC169A6NNP5 214 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 E9PMD0 336 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 K7ERI5 159 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 C2CD2LO14523 706 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 N4BP3O15049 544 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 KLRC2P26717 231 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PRPHP41219 470 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 NAMPTP43490 491 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 SCNN1GP51170 649 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 AMHR2Q16671 573 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 BSNDQ8WZ55 320 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 KIFAP3Q92845 792 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 FAM122AQ96E09 287 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 FZD8Q9H461 694 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 IRAK3Q9Y616 596 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PP2D1A8MPX8 630 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 ACKR2O00590 384 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 INPPL1O15357 1258 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 TADA2AO75478 443 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PRKCBP05771 671 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 EFNA5P52803 228 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 ITIH3Q06033 890 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 IL17AQ16552 155 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 FAM187BQ17R55 369 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 CABP7Q86V35 215 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 EDAQ92838 391 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PLIN2Q99541 437 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 SNTG2Q9NY99 539 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 USP20Q9Y2K6 914 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 VWA8A3KMH1 1905 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 EFEMP2O95967 443 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 SOD2P04179 222 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 URODP06132 367 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 WEE2P0C1S8 567 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 EPCAMP16422 314 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PEX3P56589 373 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 DSC1Q08554 894 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PTPN14Q15678 1187 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 KANK3Q6NY19 840 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 ZBTB33Q86T24 672 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 RABGGTAQ92696 567 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 CDH22Q9UJ99 828 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 GDAQ9Y2T3 454 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 NR2E1Q9Y466 385 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 SFI1A8K8P3 1242 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 LILRB3O75022 631 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 HIP1RO75146 1068 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 THP07101 528 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 MYBP10242 640 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 MTHFRP42898 656 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 GLUD2P49448 558 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 ZXDAP98168 799 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 GRIK3Q13003 919 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LMO3-222ENST00000540445 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms