RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 TADA2AO75478 443 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 AMHP03971 560 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.884e-7■■■□□ 17.7
GGA3-202ENST00000538886 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 TMC7Q7Z402 723 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 UBXN4Q92575 508 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 IL17RAQ96F46 866 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 FAM84AQ96KN4 292 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 MCM3APO60318 1980 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 STAG3L1P0CL83 205 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 FGFR1P11362 822 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 CD19P15391 556 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 GIT2Q14161 759 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 UVSSAQ2YD98 709 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 ZNF394Q53GI3 561 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 UNC13DQ70J99 1090 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 HELQQ8TDG4 1101 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 TMEM169Q96HH4 297 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 MSRAQ9UJ68 235 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 TNNC2P02585 160 aa9.52□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 LUZP1Q86V48 1076 aa9.52□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.52□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.52□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.52□□□□□ -0.88
GGA3-202ENST00000538886 BICDL2A1A5D9 508 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 GPC3P51654 580 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 CDC42EP1Q00587 391 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 CAGE1Q8TC20 777 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 ZFP42Q96MM3 310 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 APOL5Q9BWW9 433 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 TMEM206Q9H813 350 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 ZNF233A6NK53 670 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 C22orf31O95567 290 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 KRT5P13647 590 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 CD58P19256 250 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 MLH1P40692 756 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PTK7Q13308 1070 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 AMHR2Q16671 573 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.896e-6■□□□□ 10.8
GGA3-202ENST00000538886 EMSYQ7Z589 1322 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 NID2Q14112 1375 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 NAMPTP43490 491 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 FAAP100Q0VG06 881 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 WDR44Q5JSH3 913 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 BSNDQ8WZ55 320 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PGBD4Q96DM1 585 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 KATNBL1Q9H079 304 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 TBX20Q9UMR3 447 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PHF24Q9UPV7 400 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 TRIM49P0CI25 452 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 TRIM49CP0CI26 452 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PRCPP42785 496 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 GCLMP48507 274 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 SCNN1GP51170 649 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 SPAG5Q96R06 1193 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 LGR5O75473 907 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms