RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	IPP	Q9Y573	584 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	NOTCH4	Q99466	2003 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	GDF9	O60383	454 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	GAS7	O60861	476 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	DNM2	P50570	870 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	JAK3	P52333	1124 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PHKB	Q93100	1093 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	EML1	O00423	815 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SLC30A4	O14863	429 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CCL16	O15467	120 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	C1R	P00736	705 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ITGA4	P13612	1032 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	HOXC13	P31276	330 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SFN	P31947	248 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	AAMP	Q13685	434 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	TDP2	O95551	362 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	FRY	Q5TBA9	3013 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB39	O15060	712 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	TSPAN1	O60635	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CPA1	P15085	419 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	AKAP5	P24588	427 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	DMWD	Q09019	674 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	AMHR2	Q16671	573 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	HR	O43593	1189 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	C8A	P07357	584 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	USP11	P51784	963 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557		Q4G0T1	1027 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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