RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 KCND2Q9NZV8 630 aa20.53■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 SV2BQ7L1I2 683 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 IQUBQ8NA54 791 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 STAMQ92783 540 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 KIFAP3Q92845 792 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 FBXL18Q96ME1 805 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 REEP2Q9BRK0 252 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 TIPINQ9BVW5 301 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 CDH22Q9UJ99 828 aa20.52■□□□□ 0.88
PUF60-218ENST00000531995 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 CA8P35219 290 aa20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PPM1AP35813 382 aa20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PLCB3Q01970 1234 aa20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 LONRF3Q496Y0 759 aa20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 FSIP1Q8NA03 581 aa20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 LZTS1Q9Y250 596 aa20.51■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 NAMPTP43490 491 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ZNF131P52739 623 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 AMHR2Q16671 573 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SUSD6Q92537 303 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 DDX12PQ92771 950 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 EDAQ92838 391 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 CUEDC2Q9H467 287 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 FSD2A1L4K1 749 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 NPTX2P47972 431 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PEX3P56589 373 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 NHLH1Q02575 133 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TFDP1Q14186 410 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 DYMQ7RTS9 669 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TMC7Q7Z402 723 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 LPPQ93052 612 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 DRC1Q96MC2 740 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 FIZ1Q96SL8 496 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TNMDQ9H2S6 317 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SPG21Q9NZD8 308 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 A0A0U1RQF3 1178 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TMEM221A6NGB7 291 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 M0R296 226 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 EDN1P05305 212 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SLFN14P0C7P3 912 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PLS3P13797 630 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SYKP43405 635 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PHKA2P46019 1235 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 KCNC3Q14003 757 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 FZD8Q9H461 694 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 DACT1Q9NYF0 836 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 CASP1P29466 404 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 KRT17Q04695 432 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PAGE5Q96GU1 130 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 IFT74Q96LB3 600 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms