RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 AMPD3Q01432 767 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 GAD1Q99259 594 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ANK1P16157 1881 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1B0GVL5 298 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PQ27 194 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PQ64 194 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PQD8 194 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ARL5CA6NH57 179 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ABLIM1O14639 778 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 GRM6O15303 877 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ITGB1P05556 798 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 IDEP14735 1019 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 GTF2BQ00403 316 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPROQ16827 1216 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZPBP2Q6X784 338 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF558Q96NG5 402 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM9Q9C026 710 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 CDT1Q9H211 546 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 PARP2Q9UGN5 583 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 TBX20Q9UMR3 447 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 HPSEQ9Y251 543 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 RECQL4O94761 1208 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFP42Q96MM3 310 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 PANK4Q9NVE7 773 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 SNTG2Q9NY99 539 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 CARNS1A5YM72 827 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 TOM1L1O75674 476 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 FGF18O76093 207 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 POMCP01189 267 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 PIGRP01833 764 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 MCF2P10911 925 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 PPM1AP35813 382 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 PBX3P40426 434 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 SCNN1GP51170 649 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 BCAR1P56945 870 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 HVCN1Q96D96 273 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 BICD1Q96G01 975 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 TCHPQ9BT92 498 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 GBP3Q9H0R5 595 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 MIOSQ9NXC5 875 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 KLK14Q9P0G3 267 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 B4GALT3O60512 393 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R37O75864 691 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 DDHD2O94830 711 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 SLFN14P0C7P3 912 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 GRM5P41594 1212 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ASIC1P78348 528 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 PLCB3Q01970 1234 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 UBE3AQ05086 875 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 COASYQ13057 564 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB33Q86T24 672 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP120Q8N960 986 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 FSIP1Q8NA03 581 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 POF1BQ8WVV4 589 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 SPG21Q9NZD8 308 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 USP25Q9UHP3 1055 aa20.83■□□□□ 0.93
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