RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 ORAI2Q96SN7 254 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PPCSQ9HAB8 311 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CASS4Q9NQ75 786 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 JADE2Q9NQC1 790 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 RGPD1P0DJD0 1748 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 IQSEC2Q5JU85 1478 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 H7C1D1 291 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 K7ESM1 405 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 MPIG6BO95866 241 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 POLD1P28340 1107 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ADCY8P40145 1251 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ECE1P42892 770 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 NEK4P51957 841 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 RNF180Q86T96 592 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 AJUBAQ96IF1 538 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 BTBD2Q9BX70 525 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 AMNQ9BXJ7 453 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 NFAT5O94916 1531 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CBX4O00257 560 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 KPNA6O60684 536 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CUTAO60888 179 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CSF2RBP32927 897 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 SOX5P35711 763 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 RAPGEF1Q13905 1077 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 OR10A5Q9H207 317 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 B4GALT6Q9UBX8 382 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 LTBP4Q8N2S1 1624 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 PPP2CBP62714 309 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PPP2CAP67775 309 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 FBXO10Q9UK96 956 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 SLIT3O75094 1523 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 EXOC5O00471 708 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 APAF1O14727 1248 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 TBX3O15119 743 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ITGB3P05106 788 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 FNTBP49356 437 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 KCNQ1P51787 676 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 RRADP55042 308 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CD83Q01151 205 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 STILQ15468 1287 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 E2F7Q96AV8 911 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ACSS2Q9NR19 701 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 MSH6P52701 1360 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 KIF24Q5T7B8 1368 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 DVL2O14641 736 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 GAS7O60861 476 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 HMGCRP04035 888 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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