RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 SNX33Q8WV41 574 aa5.19□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.19□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 UIMC1Q96RL1 719 aa5.19□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.19□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.19□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.19□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 NRP2O60462 931 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 GUCY2FP51841 1108 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 RABGGTBP53611 331 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 SPIDRQ14159 915 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 PTPROQ16827 1216 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 SPRED1Q7Z699 444 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 BORCS6Q96GS4 357 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ADOQ96SZ5 270 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 DEF6Q9H4E7 631 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 TLR9Q9NR96 1032 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 TNKSO95271 1327 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.18□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ADCY6O43306 1168 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 RBP3P10745 1247 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 OSMP13725 252 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 AGXTP21549 392 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 CANXP27824 592 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 SEPT2Q15019 361 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 MST1LQ2TV78 715 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 BTNL9Q6UXG8 535 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 Q6ZRM9 215 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 PALM2Q8IXS6 379 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 CHST13Q8NET6 341 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 IL17DQ8TAD2 202 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 EXTL1Q92935 676 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 CEP95Q96GE4 821 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 TCF25Q9BQ70 676 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 GOLGA3Q08378 1498 aa5.17□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ZMYM3Q14202 1370 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ABCA8O94911 1581 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 TNFRSF1AP19438 455 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 MCAMP43121 646 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 SLC6A9P48067 706 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 SCNN1GP51170 649 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 WNT3AP56704 352 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 NRG3P56975 720 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ODF1Q14990 250 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 HTR3DQ70Z44 454 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 D2HGDHQ8N465 521 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 JADE3Q92613 823 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 KCNH6Q9H252 994 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.16□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 POGZQ7Z3K3 1410 aa5.15□□□□□ -1.58
CLVS1-209ENST00000522928 ANKRD62A6NC57 917 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 MATN3O15232 486 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 INSRRP14616 1297 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 ANO4Q32M45 955 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 ANKS6Q68DC2 871 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 KRT40Q6A162 431 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 REPS2Q8NFH8 660 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 GPR156Q8NFN8 814 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 GREM2Q9H772 168 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.15□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 CEP72Q9P209 647 aa5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.8 ms