RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516724.1

RNU6-572P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 572, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-572P, Length 80 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-572P-201ENST00000516724 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 KLHDC4Q8TBB5 520 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 SLC39A13Q96H72 371 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 PTPN18Q99952 460 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 SPATA25Q9BR10 227 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 POLR3GLQ9BT43 218 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 MYH16Q9H6N6 1097 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 TLR9Q9NR96 1032 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 CHST12Q9NRB3 414 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 LANCL2Q9NS86 450 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 GPRC5DQ9NZD1 345 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 FAM184BQ9ULE4 1060 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 L1RE1Q9UN81 338 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 FAM50BQ9Y247 325 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 KCTD3Q9Y597 815 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-572P-201ENST00000516724 A0A088AWK7 358 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 C2orf78A6NCI8 922 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 GOLIM4O00461 696 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 APAF1O14727 1248 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 PMM2O15305 246 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 VSIG10L2P0DP72 767 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 MYBP10242 640 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 SREBF1P36956 1147 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 SLC6A9P48067 706 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 RRADP55042 308 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 GJA9P57773 515 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 DUSP2Q05923 314 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 NOGQ13253 232 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 SEMA5AQ13591 1074 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 LLGL1Q15334 1064 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 KIAA0753Q2KHM9 967 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF568Q3ZCX4 644 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 LONRF3Q496Y0 759 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 MCTP2Q6DN12 878 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 IL31Q6EBC2 164 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 ATG14Q6ZNE5 492 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 RSPH3Q86UC2 560 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 TMEM151BQ8IW70 566 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 MRGPRX4Q96LA9 322 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 SAMD11Q96NU1 681 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 SLC38A3Q99624 504 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 TMEM140Q9NV12 185 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 SIK3Q9Y2K2 1263 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 FFAR3O14843 346 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 ARHGAP6O43182 974 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 TEX33O43247 280 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 MGEA5O60502 916 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 ITGA10O75578 1167 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 TOX4O94842 621 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 TSPAN15O95858 294 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 HTR3AP46098 478 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 NEK3P51956 506 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 BPIFB4P59827 614 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 RAB1AP62820 205 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 SP140Q13342 867 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 NFYCQ13952 458 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 MORC3Q14149 939 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 FGL2Q14314 439 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 ATP2B3Q16720 1220 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 RNF220Q5VTB9 566 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 KRT40Q6A162 431 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 MCTP1Q6DN14 999 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 GPR155Q7Z3F1 870 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 CCHCR1Q8TD31 782 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 TMX3Q96JJ7 454 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 TNIP3Q96KP6 325 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-572P-201ENST00000516724 DMRTA2Q96SC8 542 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms