RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-209ENST00000504450 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
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SH3BP2-209ENST00000504450 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 AGPAT1Q99943 283 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
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SH3BP2-209ENST00000504450 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.67□□□□□ -0.54
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SH3BP2-209ENST00000504450 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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