RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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RBM39-242ENST00000498280 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MSRAQ9UJ68 235 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TLDC2A0PJX2 215 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MYADML2A6NDP7 307 aa3.53□□□□□ -1.84
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RBM39-242ENST00000498280 CANXP27824 592 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 BLOC1S1P78537 153 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 DSG1Q02413 1049 aa3.53□□□□□ -1.84
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RBM39-242ENST00000498280 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 MAN2A1Q16706 1144 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 ABHD15Q6UXT9 468 aa3.53□□□□□ -1.84
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RBM39-242ENST00000498280 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 SH3TC2Q8TF17 1288 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 GAB3Q8WWW8 586 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.53□□□□□ -1.84
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RBM39-242ENST00000498280 FERMT2Q96AC1 680 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 CEP95Q96GE4 821 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 COQ10AQ96MF6 247 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 PDCD2LQ9BRP1 358 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 HDAC5Q9UQL6 1122 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.53□□□□□ -1.84
RBM39-242ENST00000498280 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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RBM39-242ENST00000498280 NRP1O14786 923 aa3.52□□□□□ -1.85
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RBM39-242ENST00000498280 CLEC2LP0C7M8 214 aa3.52□□□□□ -1.85
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RBM39-242ENST00000498280 DUSP2Q05923 314 aa3.52□□□□□ -1.85
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RBM39-242ENST00000498280 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RBM39-242ENST00000498280 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.52□□□□□ -1.85
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RBM39-242ENST00000498280 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.52□□□□□ -1.85
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RBM39-242ENST00000498280 MPLP40238 635 aa3.51□□□□□ -1.85
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RBM39-242ENST00000498280 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.5□□□□□ -1.85
RBM39-242ENST00000498280 EFHBQ8N7U6 833 aa3.5□□□□□ -1.85
RBM39-242ENST00000498280 REPS2Q8NFH8 660 aa3.5□□□□□ -1.85
RBM39-242ENST00000498280 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa3.5□□□□□ -1.85
RBM39-242ENST00000498280 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.5□□□□□ -1.85
RBM39-242ENST00000498280 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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