RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	HINFP	Q9BQA5	517 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO3	Q9BYT9	981 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	UST	Q9Y2C2	406 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SERTM1	A2A2V5	107 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG7	O95352	703 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	C22orf31	O95567	290 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	EOMES	O95936	686 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNE2	O96020	404 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	AOC1	P19801	751 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TMOD1	P28289	359 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM5	P33992	734 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCN3	P51790	818 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCY7	P51828	1080 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	DPYD	Q12882	1025 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	DSC3	Q14574	896 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ANGPT1	Q15389	498 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	KANK3	Q6NY19	840 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MICU3	Q86XE3	530 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS52	Q8N1B4	723 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM87B	Q96K49	555 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	PLXNA3	P51805	1871 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEB2	O15479	319 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR32	O75388	356 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHD	P01880	384 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	EPCAM	P16422	314 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP4A	P20648	1035 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	BCAR1	P56945	870 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TDG	Q13569	410 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GIT2	Q14161	759 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMM50	Q9Y512	469 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MEIS1	O00470	390 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	PI15	O43692	258 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CHML	P26374	656 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GAS6	Q14393	721 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC22	Q5TAA0	569 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCB	Q8NB91	859 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MTA3	Q9BTC8	594 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF19A	Q9NV58	838 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SMCO2	A6NFE2	343 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	PSAP	P07602	524 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRC2	P26717	231 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SREBF1	P36956	1147 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	AP3B2	Q13367	1082 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		12.22	□□□□□ -0.45

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