RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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C9orf135-204ENST00000495399 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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