RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	INPPL1	O15357	1258 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	SCP2	P22307	547 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	NDUFA8	P51970	172 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	AMPD3	Q01432	767 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	HACE1	Q8IYU2	909 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	P2RX5	Q93086	422 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	SNTG2	Q9NY99	539 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ARL5C	A6NH57	179 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	SLFN14	P0C7P3	912 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	LAG3	P18627	525 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CASP1	P29466	404 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZPBP2	Q6X784	338 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	FSIP1	Q8NA03	581 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZFP42	Q96MM3	310 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	STRA6	Q9BX79	667 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CDT1	Q9H211	546 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	AAAS	Q9NRG9	546 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	KLK14	Q9P0G3	267 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	PARP2	Q9UGN5	583 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	GRM6	O15303	877 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	POMC	P01189	267 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ITGB1	P05556	798 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	MLH1	P40692	756 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	AFM	P43652	599 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB33	Q86T24	672 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	URGCP	Q8TCY9	931 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		28.3	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	B4GALT3	O60512	393 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	TOM1L1	O75674	476 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	PPP1R37	O75864	691 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	DDHD2	O94830	711 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	PBX3	P40426	434 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	SYK	P43405	635 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	PAGE5	Q96GU1	130 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	USP25	Q9UHP3	1055 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	MYO7A	Q13402	2215 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	PIGR	P01833	764 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	MCF2	P10911	925 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	BCAR1	P56945	870 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	COASY	Q13057	564 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CEP120	Q8N960	986 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF558	Q96NG5	402 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	TCHP	Q9BT92	498 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CIT	O14578	2027 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	RECQL4	O94761	1208 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	DNAJB1	P25685	340 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ABCD1	P33897	745 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	SCNN1G	P51170	649 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CASP5	P51878	434 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ASIC1	P78348	528 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	CUL4B	Q13620	913 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	HPS3	Q969F9	1004 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	GDA	Q9Y2T3	454 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	TRANK1	O15050	2925 aa		28.26	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		28.26	■■■□□ 2.12
TTC3-223	ENST00000492275	FGF18	O76093	207 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	GALT	P07902	379 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	MYB	P10242	640 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	GRM5	P41594	1212 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	MCL1	Q07820	350 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	CAMK1	Q14012	370 aa		28.26	■■■□□ 2.11

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