RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	SOD2	P04179	222 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	AXL	P30530	894 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	CLCN6	P51797	869 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	TCF15	Q12870	199 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	GIT2	Q14161	759 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	GSE1	Q14687	1217 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	ECM1	Q16610	540 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	KIF2C	Q99661	725 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A1B0GUA9	196 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	UROD	P06132	367 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	RFPL2	O75678	378 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	AVPR2	P30518	371 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	FZD8	Q9H461	694 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PTGES	O14684	152 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	LIG1	P18858	919 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	CYP11B2	P19099	503 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	RPA1	P27694	616 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	GLUD2	P49448	558 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	DSG1	Q02413	1049 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	TTC38	Q5R3I4	469 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM204A-208	ENST00000487269	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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