RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482686.5

PRKCZ-218, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-218ENST00000482686 USP49Q70CQ1 688 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 DRC1Q96MC2 740 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 MARCH5Q9NX47 278 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 PLXNA3P51805 1871 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 NRP1O14786 923 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 STX6O43752 255 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 PLCG1P19174 1290 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 UBA7P41226 1012 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 EFNA5P52803 228 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 SPECC1Q5M775 1068 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 HACE1Q8IYU2 909 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 USP28Q96RU2 1077 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 SNTG2Q9NY99 539 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 SLC16A4O15374 487 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 RECQL4O94761 1208 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 OR1G1P47890 313 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 KCNC3Q14003 757 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 ARSHQ5FYA8 562 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 HSCBQ8IWL3 235 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 RABGGTAQ92696 567 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 K7ERI5 159 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CXCL14O95715 111 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CTSAP10619 480 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 MCM6Q14566 821 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 GPBP1Q86WP2 473 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CALML4Q96GE6 196 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 EPSTI1Q96J88 318 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CLIC6Q96NY7 704 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 GDAQ9Y2T3 454 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 PTGESO14684 152 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 SLC26A4O43511 780 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 ALDH2P05091 517 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 GRIK3Q13003 919 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 COASYQ13057 564 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CEP120Q8N960 986 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 TIPINQ9BVW5 301 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 APOL5Q9BWW9 433 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 VWA8A3KMH1 1905 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CARNS1A5YM72 827 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 PLS3P13797 630 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 ZP2Q05996 745 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 PTPN14Q15678 1187 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 RAD54LQ92698 747 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 REEP2Q9BRK0 252 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 CDT1Q9H211 546 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 MUC3AQ02505 3323 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-218ENST00000482686 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCZ-218ENST00000482686 ABLIM1O14639 778 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCZ-218ENST00000482686 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRKCZ-218ENST00000482686 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCZ-218ENST00000482686 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCZ-218ENST00000482686 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCZ-218ENST00000482686 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCZ-218ENST00000482686 GJD3Q8N144 294 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCZ-218ENST00000482686 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms