RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 USP37Q86T82 979 aa23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 UBXN4Q92575 508 aa23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 ANO9A1A5B4 782 aa23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 BUB1O43683 1085 aa23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 MSCO60682 206 aa23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 GJB1P08034 283 aa23.56■■□□□ 1.36
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USP13-202ENST00000482333 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.56■■□□□ 1.36
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USP13-202ENST00000482333 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.56■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 ZNF516Q92618 1163 aa23.56■■□□□ 1.36
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USP13-202ENST00000482333 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.55■■□□□ 1.36
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USP13-202ENST00000482333 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.55■■□□□ 1.36
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USP13-202ENST00000482333 NOX5Q96PH1 765 aa23.55■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.55■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.55■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 SRGAP2O75044 1071 aa23.54■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 ZNF286BP0CG31 522 aa23.54■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 SMPD1P17405 629 aa23.54■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.54■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.54■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 CEP112Q8N8E3 955 aa23.54■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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USP13-202ENST00000482333 C22orf31O95567 290 aa23.54■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 INSRRP14616 1297 aa23.54■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.361e-6■■■■□ 24.8
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USP13-202ENST00000482333 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.52■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 TEX35Q5T0J7 233 aa23.52■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.52■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.52■■□□□ 1.36
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USP13-202ENST00000482333 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.52■■□□□ 1.36
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USP13-202ENST00000482333 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 SEZ6Q53EL9 994 aa23.52■■□□□ 1.36
USP13-202ENST00000482333 MORN1Q5T089 497 aa23.52■■□□□ 1.36
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USP13-202ENST00000482333 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
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USP13-202ENST00000482333 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 SLC20A1Q8WUM9 679 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 NLRP4Q96MN2 994 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 FNBP1Q96RU3 617 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 EPC1Q9H2F5 836 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 CLDN3O15551 220 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 FAM189A1O60320 539 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MAPK6Q16659 721 aa23.51■■□□□ 1.35
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