RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POTEGQ6S5H5 508 aa18.2■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.2■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POU5F1BQ06416 359 aa18.19■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STAT3P40763 770 aa18.19■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HADHAP40939 763 aa18.19■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HDAC4P56524 1084 aa18.19■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DAB2P98082 770 aa18.18■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.18■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEC16BQ96JE7 1060 aa18.18■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BARHL2Q9NY43 387 aa18.18■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF17Q9P2E2 1029 aa18.18■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHRNA5P30532 468 aa18.18■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCNA1P78396 465 aa18.18■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EDEM3Q9BZQ6 932 aa18.18■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM10Q9UDY6 481 aa18.18■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT7P08729 469 aa18.17■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP5M1Q9H0R1 490 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EHD2Q9NZN4 543 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEKT2Q9UIF3 430 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYTH1Q15438 398 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AGR3Q8TD06 166 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNX19Q92543 992 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.17■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM49CP0CI26 452 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM179Q6ZVK1 233 aa18.17■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DACH2Q96NX9 599 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCB11O95342 1321 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DENND3A2RUS2 1198 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPC3P51654 580 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNB1Q14721 858 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LONRF1Q17RB8 773 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.17■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEK2P51955 445 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNA1Q09470 495 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.16■□□□□ 0.5
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