RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 CENPPQ6IPU0 288 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB33Q86T24 672 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 CEP120Q8N960 986 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 RNF19AQ9NV58 838 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 HES2Q9Y543 173 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 PDXKO00764 312 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 GARTP22102 1010 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R2P41236 205 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TOP1MTQ969P6 601 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 RNF39Q9H2S5 420 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 ZBBXA8MT70 800 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 AMHP03971 560 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 SKIP12755 728 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 GRM5P41594 1212 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 MLKLQ8NB16 471 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TCHPQ9BT92 498 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 DMAC2Q9NW81 257 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 LAMA3Q16787 3333 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 PSMA7O14818 248 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 OGTO15294 1046 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 EOMESO95936 686 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 KCNJ6P48051 423 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 NFIL3Q16649 462 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TMEM192Q8IY95 271 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 LPPQ93052 612 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 MED15Q96RN5 788 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 SLC9A7Q96T83 725 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 STIM1Q13586 685 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TTI2Q6NXR4 508 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 P2RX5Q93086 422 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 FBXL18Q96ME1 805 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-210ENST00000477812 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CLIC2O15247 247 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 INPPL1O15357 1258 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 RECQL4O94761 1208 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 NR3C1P04150 777 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 STAG3L1P0CL83 205 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 FGFR1P11362 822 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CCNE1P24864 410 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 TNFSF9P41273 254 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 LRRC63Q05C16 580 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 TYRO3Q06418 890 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 SEZ6Q53EL9 994 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 TDHQ8IZJ6 230 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 NELFBQ8WX92 580 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 SAAL1Q96ER3 474 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 SNTG2Q9NY99 539 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 SYCE3A1L190 88 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 DGKIO75912 1065 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 GJB5O95377 273 aa21.75■■□□□ 1.07
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