RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472800.1

AUP1-207, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene AUP1, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-207ENST00000472800 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 MCL1Q07820 350 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 STK4Q13043 487 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 GRIN2CQ14957 1233 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 IPPQ9Y573 584 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.54■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 ABLIM1O14639 778 aa21.53■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 NPTXRO95502 500 aa21.53■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 RAB30Q15771 203 aa21.53■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 KYAT1Q16773 422 aa21.53■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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AUP1-207ENST00000472800 GPT2Q8TD30 523 aa21.53■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.53■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 TLL1O43897 1013 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 ITGA4P13612 1032 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 KCNA1Q09470 495 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 GBP3Q9H0R5 595 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 CDT1Q9H211 546 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 ZNF576Q9H609 170 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 MSRAQ9UJ68 235 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.52■■□□□ 1.04
AUP1-207ENST00000472800 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 CAMK4Q16566 473 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 RNF169Q8NCN4 708 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 TIFAQ96CG3 184 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 YME1L1Q96TA2 773 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.51■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 A0A0B4J269 797 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 GARTP22102 1010 aa21.5■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 HOXD13P35453 343 aa21.5■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.5■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.5■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.5■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 CDH23Q9H251 3354 aa21.5■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 INPPL1O15357 1258 aa21.49■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 ZBTB33Q86T24 672 aa21.49■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.49■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.48■■□□□ 1.03
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AUP1-207ENST00000472800 PBX4Q9BYU1 374 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 PARP2Q9UGN5 583 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 HES2Q9Y543 173 aa21.48■■□□□ 1.03
AUP1-207ENST00000472800 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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