RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465199.5

C1orf35-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf35, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-202ENST00000465199 AMHP03971 560 aa24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 PSMD2Q13200 908 aa24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ZPBP2Q6X784 338 aa24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 GSDMAQ96QA5 445 aa24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 RNF39Q9H2S5 420 aa24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 HES2Q9Y543 173 aa24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.11■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.452e-6■■□□□ 12.9
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF623O75123 536 aa24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ARHGEF15O94989 841 aa24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 BMP6P22004 513 aa24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ALCAMQ13740 583 aa24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 LPPQ93052 612 aa24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ACCSQ96QU6 501 aa24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 CDT1Q9H211 546 aa24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 IPPQ9Y573 584 aa24.1■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 COL4A6Q14031 1691 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 LCHNA4D1U4 455 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 DLL1O00548 723 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 TOM1L1O75674 476 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 UPP2O95045 317 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 SMC2O95347 1197 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 MBD3O95983 291 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ADSSP30520 456 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 GATMP50440 423 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 TAP1Q03518 808 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ISM2Q6H9L7 571 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ZBTB33Q86T24 672 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 CEP120Q8N960 986 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 RFXAPO00287 272 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 TGFB1I1O43294 461 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 GJB5O95377 273 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 FGFR1P11362 822 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ABCD1P33897 745 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 LIG4P49917 911 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 BICD1Q96G01 975 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf35-202ENST00000465199 TTC3P53804 2025 aa24.08■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 BIN1O00499 593 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 MCL1Q07820 350 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 MORC3Q14149 939 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM192Q8IY95 271 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 RNF169Q8NCN4 708 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 RAD9AQ99638 391 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 RMND1Q9NWS8 449 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 UBE4BO95155 1302 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 A0A0B4J269 797 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 FAM189A1O60320 539 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 RAB27AP51159 221 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 SEZ6Q53EL9 994 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 SPRED2Q7Z698 418 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM206Q9H813 350 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 EPOPA6NHQ4 379 aa24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 DGKIO75912 1065 aa24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 EOMESO95936 686 aa24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 MCF2P10911 925 aa24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 AKAP5P24588 427 aa24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 APOL6Q9BWW8 343 aa24.05■■□□□ 1.44
C1orf35-202ENST00000465199 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms