RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457718.5

TNS3-208, Transcript of tensin 3, human

TSL 5

Gene TNS3, Length 3,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS3-208	ENST00000457718	GPS1	Q13098	491 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ALG3	Q92685	438 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	CHRNA5	P30532	468 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	MSH2	P43246	934 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	NID2	Q14112	1375 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	RTN2	O75298	545 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	HSPA1L	P34931	641 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	KRT39	Q6A163	491 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ERP27	Q96DN0	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	RMDN3	Q96TC7	470 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	TXNDC9	O14530	226 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	AGT	P01019	485 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718		M0R2N6	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	GJB6	O95452	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	KRT10	P13645	584 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	PTEN	P60484	403 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ASTN1	O14525	1302 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	PIK3R2	O00459	728 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ZBED4	O75132	1171 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	RALA	P11233	206 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	P3H1	Q32P28	736 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SLC5A5	Q92911	643 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55	3e-6	■■■□□ 15.2
TNS3-208	ENST00000457718	CYTH2	Q99418	400 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	MARK3	P27448	753 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	CDO1	Q16878	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	HIPK4	Q8NE63	616 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	MAML1	Q92585	1016 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS3-208	ENST00000457718	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms