RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454356.5

MTA3-209, Transcript of metastasis associated 1 family member 3, human

TSL 5

Gene MTA3, Length 1,702 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA3-209	ENST00000454356	CRHR2	Q13324	411 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	GJD2	Q9UKL4	321 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	NENF	Q9UMX5	172 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356		H3BRB1	525 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	EVI5	O60447	810 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ANXA13	P27216	316 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ACOT2	P49753	483 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	SREBF2	Q12772	1141 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	CCL14	Q16627	93 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	METTL13	Q8N6R0	699 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ZIC5	Q96T25	663 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	CTAGE9	A4FU28	777 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	PRKCB	P05771	671 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	KLRC1	P26715	233 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	GPC3	P51654	580 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	TFDP1	Q14186	410 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	SV2A	Q7L0J3	742 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ZNF516	Q92618	1163 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ABLIM1	O14639	778 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	ASAP2	O43150	1006 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	SYT11	Q9BT88	431 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	MAGEB2	O15479	319 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	FAM189A1	O60320	539 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	TOM1L1	O75674	476 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	TM4SF4	P48230	202 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	PTEN	P60484	403 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	MAPK6	Q16659	721 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	DGKD	Q16760	1214 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	NLRP4	Q96MN2	994 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	FZD8	Q9H461	694 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MTA3-209	ENST00000454356	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	CTGF	P29279	349 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	CYP2C19	P33261	490 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	RGS2	P41220	211 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	ERO1A	Q96HE7	468 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	FAM84A	Q96KN4	292 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356		A6NJR5	290 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	KIF3C	O14782	793 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	KIF22	Q14807	665 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	KAT5	Q92993	513 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	APBA2	Q99767	749 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	RAB20	Q9NX57	234 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	PTPRJ	Q12913	1337 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	CLDN3	O15551	220 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	CYP2B6	P20813	491 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	PROZ	P22891	400 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	POU5F1B	Q06416	359 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	ACKR2	O00590	384 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	32.35	■■■□□ 2.77	6e-6	■■■■□ 21.9
MTA3-209	ENST00000454356	AMPD2	Q01433	879 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	MCL1	Q07820	350 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	NAGPA	Q9UK23	515 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	PPFIA1	Q13136	1202 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MTA3-209	ENST00000454356	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77

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