RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448333.1

KCTD3-202, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene KCTD3, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3-202ENST00000448333 EPCAMP16422 314 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 MUTP22033 750 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 NAMPTP43490 491 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 KCNC3Q14003 757 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 PPP2R5AQ15172 486 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 IL17AQ16552 155 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 RILPL1Q5EBL4 403 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 KIAA1841Q6NSI8 718 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 KANK3Q6NY19 840 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 CABP7Q86V35 215 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 COLGALT2Q8IYK4 626 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 COLEC11Q9BWP8 271 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 VN1R3Q9BXE9 311 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 FZD8Q9H461 694 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 SNTG2Q9NY99 539 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 BDP1A6H8Y1 2624 aa10.64□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 VWA3AA6NCI4 1184 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 SFI1A8K8P3 1242 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 F8W810 466 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 K7ERI5 159 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 LAD1O00515 517 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 N4BP3O15049 544 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 URODP06132 367 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 PEX3P56589 373 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 PTPN14Q15678 1187 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 TAS1R1Q7RTX1 841 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 ZBTB33Q86T24 672 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 SUSD6Q92537 303 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 KIFAP3Q92845 792 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 TBC1D32Q96NH3 1257 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 KLHL5Q96PQ7 755 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 PDZD7Q9H5P4 517 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 CACNG4Q9UBN1 327 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 GDAQ9Y2T3 454 aa10.63□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 CASTOR2A6NHX0 329 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 PRR33A8MZF0 331 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 LOC730098B7Z3J9 87 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 ACKR2O00590 384 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 TADA2AO75478 443 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 SOD2P04179 222 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 CNPP09543 421 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 PRPHP41219 470 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 FAM187BQ17R55 369 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 ATAT1Q5SQI0 421 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 EEF1DP3Q658K8 133 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 TMC5Q6UXY8 1006 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 PPFIBP1Q86W92 1011 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 HASPINQ8TF76 798 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 B3GALT6Q96L58 329 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 POMKQ9H5K3 350 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 KMT5AQ9NQR1 393 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 MARCH5Q9NX47 278 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 STK39Q9UEW8 545 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 IRAK3Q9Y616 596 aa10.62□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 HIP1RO75146 1068 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 RECQL4O94761 1208 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 EDN1P05305 212 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 THP07101 528 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 SPATA31D3P0C874 917 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 MTHFRP42898 656 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 GLUD2P49448 558 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 EFNA5P52803 228 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 OSTNP61366 133 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 ITIH3Q06033 890 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 DSC1Q08554 894 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 GRIK3Q13003 919 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 ATF7IP2Q5U623 682 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 RINT1Q6NUQ1 792 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 FUT10Q6P4F1 479 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 KCNK18Q7Z418 384 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 CEP57Q86XR8 500 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 PALB2Q86YC2 1186 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 RASSF8Q8NHQ8 419 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 FBXL18Q96ME1 805 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 RIPOR3Q96MK2 946 aa10.61□□□□□ -0.71
KCTD3-202ENST00000448333 TCHPQ9BT92 498 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms