RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442343.1

RPSAP40-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 40, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP40, Length 891 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CASD1Q96PB1 797 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 PCYT2Q99447 389 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 UBAC1Q9BSL1 405 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 AZI2Q9H6S1 392 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 STK39Q9UEW8 545 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CDH22Q9UJ99 828 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 R4GN57 208 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 COL1A2P08123 1366 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 KRBA1A5PL33 1030 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 B4E1Z4 1266 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 WNT7AO00755 349 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 MEIS2O14770 477 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 SIAH2O43255 324 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CYTH3O43739 400 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 KINO60870 393 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 PAPLNO95428 1278 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CXCL14O95715 111 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 FGFR1P11362 822 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 SMARCA1P28370 1054 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 LMNB2Q03252 620 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 MTMR1Q13613 665 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 PLCB4Q15147 1175 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 SEC23AQ15436 765 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 XKR5Q6UX68 686 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 HOMER1Q86YM7 354 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 TREML1Q86YW5 311 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ABI1Q8IZP0 508 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CUL5Q93034 780 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 PIGSQ96S52 555 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 RTKNQ9BST9 563 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 HCSTQ9UBK5 93 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 NFASCO94856 1347 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 LAMA1P25391 3075 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ANKRD62A6NC57 917 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 HBP1O60381 514 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CLSTN1O94985 981 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ADRB1P08588 477 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CTSAP10619 480 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 SRFP11831 508 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ITGB5P18084 799 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 GPC1P35052 558 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 PTGIRP43119 386 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 STAT5BP51692 787 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 GRM4Q14833 912 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 LETM2Q2VYF4 491 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 TTC22Q5TAA0 569 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CABP7Q86V35 215 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 FAM228AQ86W67 206 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM169Q96HH4 297 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 MAP3K14Q99558 947 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 ZBP1Q9H171 429 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 C12orf49Q9H741 205 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 JADE2Q9NQC1 790 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 RNF19AQ9NV58 838 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP40-201ENST00000442343 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms