RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 APOL1O14791 398 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 TLR2O60603 784 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 KCNA2P16389 499 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 MARK3P27448 753 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 C19orf60Q96EN9 201 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 RMDN3Q96TC7 470 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 NUP85Q9BW27 656 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ECT2Q9H8V3 914 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 PALD1Q9ULE6 856 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 NR3C1P04150 777 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 RGS4P49798 205 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ACTR2P61160 394 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 CUL4AQ13619 759 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 CNBD2Q96M20 576 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 PARVBQ9HBI1 364 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 GID8Q9NWU2 228 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SMAPO00193 183 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SERPINB9P50453 376 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ACCSLQ4AC99 568 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 TMEM270Q6UE05 265 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ZFYVE19Q96K21 471 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 PIGSQ96S52 555 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ABCB6Q9NP58 842 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 RASSF9O75901 435 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 YAF2Q8IY57 180 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 KCNK16Q96T55 309 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ZFATQ9P243 1243 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 TK2O00142 265 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SPAG6O75602 509 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 KLHL2O95198 593 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 PDHA1P08559 390 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 KITP10721 976 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 LUZP2Q86TE4 346 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 CALML6Q8TD86 181 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 MTA3Q9BTC8 594 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 APPL1Q9UKG1 709 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 CLRN2A0PK11 232 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 NCALDP61601 193 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 KCNH2Q12809 1159 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 LRRC24Q50LG9 513 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 HORMAD1Q86X24 394 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 HINFPQ9BQA5 517 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.05□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 LAMC1P11047 1609 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 NUMA1Q14980 2115 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 WDR62O43379 1518 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 CDC27P30260 824 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 CAPZA2P47755 286 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 CDK8P49336 464 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 EFNA5P52803 228 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 NPEPPSP55786 919 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 HPCAP84074 193 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SH3GL3Q99963 347 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ABCB11O95342 1321 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 SNTNA6NMZ2 147 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 ZBTB5O15062 677 aa7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
USP46-201ENST00000441222 KRT75O95678 551 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms