RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 CYP4F8P98187 520 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 CHRNEQ04844 493 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 IL10RAQ13651 578 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 TUBB8Q3ZCM7 444 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 TRIM63Q969Q1 353 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 APIPQ96GX9 242 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 GREM2Q9H772 168 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 CERS4Q9HA82 394 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 A0A088AWK7 358 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 SLC16A6O15403 523 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 ABCB4P21439 1286 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PPM1AP35813 382 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 MCAMP43121 646 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 GPR15P49685 360 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 MAP2K6P52564 334 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 KIR3DS1Q14943 382 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PRR16Q569H4 304 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 APOA5Q6Q788 366 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 AFAP1Q8N556 730 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 GAB3Q8WWW8 586 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 DPF2Q92785 391 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 KAT5Q92993 513 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 MTG2Q9H4K7 406 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 HECW1Q76N89 1606 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 NFIBO00712 420 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 CELA3BP08861 270 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 MC4RP32245 332 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 DSC2Q02487 901 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 FAM209BQ5JX69 171 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PCGF5Q86SE9 256 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 TTC7BQ86TV6 843 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 KIAA1191Q96A73 305 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PEX11GQ96HA9 241 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 KIRREL1Q96J84 757 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 SWAP70Q9UH65 585 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 CDC23Q9UJX2 597 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PADI4Q9UM07 663 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 FRS3O43559 492 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 COL6A1P12109 1028 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PTGS1P23219 599 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 BDNFP23560 247 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 RAB1AP62820 205 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 CCDC178Q5BJE1 867 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 DRC7Q8IY82 874 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 TOX2Q96NM4 488 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 PTPN18Q99952 460 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 ARMT1Q9H993 441 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 SCOCQ9UIL1 159 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 RICTORQ6R327 1708 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 NPATQ14207 1427 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 NRP2O60462 931 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 TLR5O60602 858 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-212ENST00000434424 OPHN1O60890 802 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms