RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GARTP22102 1010 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRM5P41594 1212 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DEFB103AP81534 67 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDE4CQ08493 712 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NFKBIBQ15653 356 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KYAT1Q16773 422 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADSSL1Q8N142 457 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PGBD4Q96DM1 585 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDT1Q9H211 546 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IPPQ9Y573 584 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TISP43B9A030 160 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BIN1O00499 593 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOXA2O43364 376 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DGKIO75912 1065 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GJB5O95377 273 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRCPP42785 496 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYBPC2Q14324 1141 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NFIL3Q16649 462 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HACE1Q8IYU2 909 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MLKLQ8NB16 471 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TCHPQ9BT92 498 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF19AQ9NV58 838 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDR81Q562E7 1941 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SIP14410 1827 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSMA7O14818 248 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OGTO15294 1046 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLTAP09496 248 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGFR1P11362 822 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ITGA4P13612 1032 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STIM1Q13586 685 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 XKR4Q5GH76 650 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CENPPQ6IPU0 288 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBTB33Q86T24 672 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEP120Q8N960 986 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXL18Q96ME1 805 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RSAD1Q9HA92 442 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DMAC2Q9NW81 257 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HES2Q9Y543 173 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 INSL6Q9Y581 213 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.91□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms