RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 USTQ9Y2C2 406 aa23.06■■□□□ 1.28
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UBXN4-204ENST00000426921 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
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UBXN4-204ENST00000426921 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.05■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
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UBXN4-204ENST00000426921 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.03■■□□□ 1.28
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UBXN4-204ENST00000426921 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.99■■□□□ 1.27
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.99■■□□□ 1.27
UBXN4-204ENST00000426921 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.99■■□□□ 1.27
UBXN4-204ENST00000426921 PRRX2Q99811 253 aa22.99■■□□□ 1.27
UBXN4-204ENST00000426921 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
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