RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXA9P31269 272 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTAPQ13126 283 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBXN11Q5T124 520 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FUT10Q6P4F1 479 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOC8Q8IYI6 725 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEMA4GQ9NTN9 838 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXW11Q9UKB1 542 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATRXP46100 2492 aa18.52■□□□□ 0.56
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNA11P29992 359 aa18.51■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSRP2Q16527 193 aa18.51■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC5A5Q92911 643 aa18.51■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B3GALT6Q96L58 329 aa18.51■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KXD1Q9BQD3 176 aa18.51■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR62Q9BZJ7 368 aa18.51■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.51■□□□□ 0.55
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 STBD1O95210 358 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL17P18621 184 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLH1P40692 756 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NTHL1P78549 312 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHC2P98077 582 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LPAL2Q16609 132 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR23CQ6ZRP0 262 aa18.5■□□□□ 0.55
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAD1Q99259 594 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IPPQ9Y573 584 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL4A3Q01955 1670 aa18.5■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR81Q562E7 1941 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM150BA6NC51 233 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F8W810 466 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAN2B1O00754 1011 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC27A2O14975 620 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ECI2O75521 394 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C8AP07357 584 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POU2F2P09086 479 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TDGF1P13385 188 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AXLP30530 894 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCNN1GP51170 649 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP11P51784 963 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FZD5Q13467 585 aa18.49■□□□□ 0.55
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 HACE1Q8IYU2 909 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC51Q96ER9 411 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHRDQ9H2X0 955 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLIQ9UNA4 740 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM208BQ5VWN6 2430 aa18.49■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERLIN2O94905 339 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNA4P22459 653 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMLP29590 882 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCR3P51677 355 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL31Q6EBC2 164 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITFG1Q8TB96 612 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNASE1L2Q92874 299 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPME1Q9Y570 386 aa18.48■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.558e-6■■■■■ 107
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCL16O15467 120 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TADA2AO75478 443 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMD10O75832 226 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RCAN1P53805 252 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UVSSAQ2YD98 709 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOTUMQ6P988 496 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANO5Q75V66 913 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTL10Q7L3V2 364 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFP42Q96MM3 310 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIOSQ9NXC5 875 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GDE1Q9NZC3 331 aa18.47■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASAP2O43150 1006 aa18.46■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNR2P34972 360 aa18.46■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMC5P62195 406 aa18.46■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.46■□□□□ 0.55
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