RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CLDN3	O15551	220 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	EXTL3	O43909	919 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CHRNA1	P02708	482 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ADRB2	P07550	413 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CDC25B	P30305	580 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	MCL1	Q07820	350 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	COL6A1	P12109	1028 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	KRT13	P13646	458 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	BFSP1	Q12934	665 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	NR1I3	Q14994	352 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CDT1	Q9H211	546 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1B0GUA9	196 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	OGT	O15294	1046 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	TEX33	O43247	280 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM189A1	O60320	539 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CD4	P01730	458 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	MCF2	P10911	925 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CKB	P12277	381 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CAPN2	P17655	700 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	AXL	P30530	894 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ACOT2	P49753	483 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	UBXN1	Q04323	297 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	RBL2	Q08999	1139 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	NDST4	Q9H3R1	872 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	VAMP7	P51809	220 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	BFSP2	Q13515	415 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	VSTM4	Q8IW00	320 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAAP20-208	ENST00000420964	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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