RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 AOC1P19801 751 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 NBL1P41271 181 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 CALCRLQ16602 461 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 WASF1Q92558 559 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 CA14Q9ULX7 337 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 CFAP54Q96N23 3096 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 PROB1E7EW31 1015 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 PFKFB2O60825 505 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 NPR3P17342 541 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 TXKP42681 527 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 FUT10Q6P4F1 479 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-202ENST00000415164 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 DGAT1O75907 488 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 DSG1Q02413 1049 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 DSC1Q08554 894 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ANGPT1Q15389 498 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 NECAB1Q8N987 351 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 HASPINQ8TF76 798 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 MYADMQ96S97 322 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 PLXNA3P51805 1871 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 TGM5O43548 720 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 TADA2AO75478 443 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 CTDNEP1O95476 244 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 GLRA2P23416 452 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 AMHR2Q16671 573 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 USP41Q3LFD5 358 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 NEMFO60524 1076 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 LIG1P18858 919 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ATP2B1P20020 1258 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ARL2P36404 184 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 SPECC1Q5M775 1068 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 DMDP11532 3685 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 RARRES1P49788 294 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 GRIK3Q13003 919 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 CEP57Q86XR8 500 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ADSSL1Q8N142 457 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 KRBA1A5PL33 1030 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 POTEMA6NI47 508 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 POU5F1BQ06416 359 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 TRIM29Q14134 588 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD1Q15327 319 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 CHST7Q9NS84 486 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ARID2Q68CP9 1835 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 BTBD18B2RXH4 712 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 LYPLA2O95372 231 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 CREMQ03060 361 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 GPR152Q8TDT2 470 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 TNFRSF25Q93038 417 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms