RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.292e-6■□□□□ 10.9
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SH3BP4-203ENST00000409212 SNF8Q96H20 258 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 GNGT2O14610 69 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 CSPG5O95196 566 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 RFC5P40937 340 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ELMOD1Q8N336 334 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 IFT43Q96FT9 208 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ADAM21Q9UKJ8 722 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC25A27O95847 323 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 OCRLQ01968 901 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 PDCLQ13371 301 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 PSMD14O00487 310 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 RBP5P82980 135 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SPATA4Q8NEY3 305 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 POLIQ9UNA4 740 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ASAP2O43150 1006 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 CDH6P55285 790 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP11CQ8NB49 1132 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 RUBCNQ92622 972 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SENP2Q9HC62 589 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 APOEP02649 317 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 UCHL3P15374 230 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SNAPC2Q13487 334 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SNX12Q9UMY4 172 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 GSTA4O15217 222 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 FOXP2O15409 715 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 GGCXP38435 758 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 DMTNQ08495 405 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 MTF1Q14872 753 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 NR1I3Q14994 352 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 USP49Q70CQ1 688 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 AGBL3Q8NEM8 1001 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 C18orf8Q96DM3 657 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ESYT3A0FGR9 886 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 CTDNEP1O95476 244 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 TROAPQ12815 778 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM143Q96AN5 459 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 GH1P01241 217 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 PPM1NQ8N819 430 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 FGD4Q96M96 766 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 CDK17Q00537 523 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 RASIP1Q5U651 963 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 CHST13Q8NET6 341 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 56.2
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SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 SUN2Q9UH99 717 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 VPS11Q9H270 941 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 TECPR2O15040 1411 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 MGEA5O60502 916 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 EMC2Q15006 297 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 AFG1LQ8WV93 481 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 GGA3Q9NZ52 723 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP2R2AP63151 447 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 DRP2Q13474 957 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 FSCBQ5H9T9 825 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-203ENST00000409212 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16.84■□□□□ 0.29
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