RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00271P0C7V0 271 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMPR1AP36894 532 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AFMP43652 599 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIG4P49917 911 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GATMP50440 423 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCL1Q07820 350 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRIN2CQ14957 1233 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KYAT1Q16773 422 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF568Q3ZCX4 644 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPC2Q52LR7 807 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EEF1DP3Q658K8 133 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LPPQ93052 612 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BICD1Q96G01 975 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCHPQ9BT92 498 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDT1Q9H211 546 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KAT6AQ92794 2004 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIP14410 1827 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABLIM1O14639 778 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCNT3O95395 438 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRM5P41594 1212 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EHHADHQ08426 723 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CUL4BQ13620 913 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q7L0L9 218 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 P2RX5Q93086 422 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIGD1Q96MW7 591 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACCSQ96QU6 501 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM206Q9H813 350 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARID2Q68CP9 1835 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARL5CA6NH57 179 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTNNB1P35222 781 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPM1AP35813 382 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YARSP54577 528 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2HP62256 183 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMD2Q13200 908 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TET1Q8NFU7 2136 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM161BQ96MY7 647 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CWH43Q9H720 699 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP20Q9Y2K6 914 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HES2Q9Y543 173 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE4BO95155 1302 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BNC9 293 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MLH1P40692 756 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POSTNQ15063 836 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF558Q96NG5 402 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GUCD1Q96NT3 240 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAD1Q99259 594 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APOL6Q9BWW8 343 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXOC1Q9NV70 894 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNTG2Q9NY99 539 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PARP2Q9UGN5 583 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STYXL1Q9Y6J8 313 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0B4J269 797 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RECQL4O94761 1208 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYBP10242 640 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKAP5P24588 427 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms