RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390967.1

RNU6-788P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 788, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-788P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-788P-201ENST00000390967 CROCCQ5TZA2 2017 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 CCDC151A5D8V7 595 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 TARM1B6A8C7 271 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 GIPC1O14908 333 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 ADAMTS3O15072 1205 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 ORC4O43929 436 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 ARHGAP4P98171 946 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 LSAMPQ13449 338 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 METRNLQ641Q3 311 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 KRT40Q6A162 431 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 LRSAM1Q6UWE0 723 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 PIP4P1Q86T03 277 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 PIM3Q86V86 326 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 CHAMP1Q96JM3 812 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 CDIP1Q9H305 208 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 C12orf49Q9H741 205 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 DMTF1Q9Y222 760 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 PRRT4C9JH25 899 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 MYO1FO00160 1098 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 PEX1O43933 1283 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 PTGS1P23219 599 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 KRTAP12-4P60329 112 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 MPP2Q14168 576 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 TCEAL1Q15170 157 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 KAZNQ674X7 775 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 IQCEQ6IPM2 695 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 RCBTB1Q8NDN9 531 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 NPLOC4Q8TAT6 608 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 ZNF398Q8TD17 642 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 MED30Q96HR3 178 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 DMRTB1Q96MA1 342 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 JAM3Q9BX67 310 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 AMNQ9BXJ7 453 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 RMI1Q9H9A7 625 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 SPON1Q9HCB6 807 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 KCNG2Q9UJ96 466 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 NFS1Q9Y697 457 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-788P-201ENST00000390967 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 AGRNO00468 2067 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 PF4P02776 101 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 MC4RP32245 332 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 GLIPR1P48060 266 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 RBM25P49756 843 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 KRTAP10-10P60014 251 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 CYP4F3Q08477 520 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 GRB10Q13322 594 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 LPAL2Q16609 132 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 C10orf25Q5T742 122 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 RAPH1Q70E73 1250 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 LNX2Q8N448 690 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 HAPLN3Q96S86 360 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 MMS19Q96T76 1030 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 NEU1Q99519 415 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 MTFR1LQ9H019 292 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 WHRNQ9P202 907 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 WWC3Q9ULE0 1092 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 LINC00473A8K010 186 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 MPIG6BO95866 241 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 JUNP05412 331 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 ECE1P42892 770 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 ERVFC1-1P60608 527 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 LMNB2Q03252 620 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 PLA2G15Q8NCC3 412 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 DIO2Q92813 273 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 OR10A5Q9H207 317 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 WFDC1Q9HC57 220 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 BRMS1Q9HCU9 246 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 F6X3S4 739 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 ZG16O60844 167 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-788P-201ENST00000390967 APOHP02749 345 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms