RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA8P51970 172 aa16.87■□□□□ 0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.87■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.87■□□□□ 0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.87■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 CHD9Q3L8U1 2897 aa16.87■□□□□ 0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 29.8
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 NR1I2O75469 434 aa16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF202O95125 648 aa16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 GRM5P41594 1212 aa16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB33Q86T24 672 aa16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNF39Q9H2S5 420 aa16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 SNTG2Q9NY99 539 aa16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 MCL1Q07820 350 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 POSTNQ15063 836 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 SPRED2Q7Z698 418 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.83■□□□□ 0.28
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