RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 ADPGKQ9BRR6 497 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 INPPL1O15357 1258 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 MCM2P49736 904 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 RILPL1Q5EBL4 403 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 ZBTB33Q86T24 672 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 IGSF22Q8N9C0 903 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 KIFAP3Q92845 792 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 RIPOR3Q96MK2 946 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 NECTIN4Q96NY8 510 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 KIFC3Q9BVG8 833 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 ADAM7Q9H2U9 754 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 FZD8Q9H461 694 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 MARCH5Q9NX47 278 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 MIOSQ9NXC5 875 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 CDH22Q9UJ99 828 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 SOD2P04179 222 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 DSC1Q08554 894 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 GRIK3Q13003 919 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 FAM187BQ17R55 369 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 KIAA1841Q6NSI8 718 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 FAM122AQ96E09 287 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 COLEC11Q9BWP8 271 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 PDZD7Q9H5P4 517 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 POLD4Q9HCU8 107 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 DNM3Q9UQ16 869 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 SMC3Q9UQE7 1217 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 NR2E1Q9Y466 385 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 PP2D1A8MPX8 630 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 WEE2P0C1S8 567 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 PRPHP41219 470 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 MTHFRP42898 656 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 GLUD2P49448 558 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 KLHL5Q96PQ7 755 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 CNPP09543 421 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 SLC22A17Q8WUG5 538 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 EDAQ92838 391 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 POMKQ9H5K3 350 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 E9PMD0 336 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 ACKR2O00590 384 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 EFNA5P52803 228 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 FBXL18Q96ME1 805 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC113Q9H0I3 377 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 SFXN1Q9H9B4 322 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 USP20Q9Y2K6 914 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 TTLL13PA6NNM8 815 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC169A6NNP5 214 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 F8W810 466 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 ADH1AP07327 375 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 CDC25AP30304 524 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 PLA2G5P39877 138 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 ATAT1Q5SQI0 421 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 KANK3Q6NY19 840 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 TMC5Q6UXY8 1006 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 SNTG2Q9NY99 539 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-202ENST00000378546 CLCN4P51793 760 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 GSTCDQ8NEC7 633 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 RABGGTAQ92696 567 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 RECQL4O94761 1208 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 PEX3P56589 373 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 IL17AQ16552 155 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 FUT10Q6P4F1 479 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 HFE2Q6ZVN8 426 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 TAS1R1Q7RTX1 841 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 DRC1Q96MC2 740 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 ADAM28Q9UKQ2 775 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 GDAQ9Y2T3 454 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 VWA3AA6NCI4 1184 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 CASTOR2A6NHX0 329 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 K7ERI5 159 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 HIP1RO75146 1068 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 TADA2AO75478 443 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 ZXDAP98168 799 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 TUSC3Q13454 348 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 ATF7IP2Q5U623 682 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 EEF1DP3Q658K8 133 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM67Q6ZTA4 783 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 B3GALT6Q96L58 329 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 CACNG4Q9UBN1 327 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM221A6NGB7 291 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 M0R296 226 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 TEX28O15482 410 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 GLUD1P00367 558 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-202ENST00000378546 EDN1P05305 212 aa28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms