RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.38■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.38■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 MID2Q9UJV3 735 aa22.38■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.38■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ZBBXA8MT70 800 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SEMA3FQ13275 785 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 BARGINQ6ZT62 677 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 LPAR1Q92633 364 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SIK2Q9H0K1 926 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 GGA3Q9NZ52 723 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TAC1P20366 129 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 EFNA5P52803 228 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SPARCL1Q14515 664 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 FGD4Q96M96 766 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 RASSF3Q86WH2 238 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ADSSL1Q8N142 457 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 KRT7P08729 469 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 USP49Q70CQ1 688 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 RPAINQ86UA6 219 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 RFFLQ8WZ73 363 aa22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 EFHC2Q5JST6 749 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 VPS39Q96JC1 886 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 USH1CQ9Y6N9 552 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 KRT33BQ14525 404 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 KIF19Q2TAC6 998 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TECPR2O15040 1411 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 OCRLQ01968 901 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 NLRP14Q86W24 1093 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 KCNB2Q92953 911 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 VCPKMTQ9H867 229 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CHRNA3P32297 505 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 AP3M2P53677 418 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 MAPK13O15264 365 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CPB1P15086 417 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 PPM1NQ8N819 430 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CHEK2O96017 543 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 HOXD10P28358 340 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 PPP2R2AP63151 447 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 DRP2Q13474 957 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SNX12Q9UMY4 172 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 GMNCA6NCL1 334 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 RTN2O75298 545 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CAV1Q03135 178 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 FAM151AQ8WW52 585 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 MOSPD1Q9UJG1 213 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 DPEP1P16444 411 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CDH6P55285 790 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 BCAR1P56945 870 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 STK4Q13043 487 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 XKR3Q5GH77 459 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ICE2Q659A1 982 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SNF8Q96H20 258 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms