RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359785.9

PTPN22-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN22, Length 3,654 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22-201ENST00000359785 SYT15Q9BQS2 421 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ECT2Q9H8V3 914 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PDXKO00764 312 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ABCB7O75027 752 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 MMEP08473 750 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 GM2AP17900 193 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ITGA6P23229 1130 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 NME8Q8N427 588 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 OGFOD1Q8N543 542 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PNMA5Q96PV4 448 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 VPS11Q9H270 941 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 UVRAGQ9P2Y5 699 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 RASAL2Q9UJF2 1139 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 UBOX5O94941 541 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SLC18A2Q05940 514 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SLC34A1Q06495 639 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 GRB10Q13322 594 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 CLDN10P78369 228 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 TMEM110Q86TL2 294 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 METTL13Q8N6R0 699 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TEKT4Q8WW24 435 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPN22-201ENST00000359785 C7orf26Q96N11 449 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ANKRD2Q9GZV1 360 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 F5H6K3 240 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 EPHB6O15197 1021 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 MARCH6O60337 910 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 SRGAP2O75044 1071 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 C1QAP02745 245 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 AOC1P19801 751 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 KLRC2P26717 231 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 KIF5BP33176 963 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 FLT3P36888 993 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 SLC1A4P43007 532 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPN22-201ENST00000359785 SEC24CP53992 1094 aa4.84□□□□□ -1.64
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