RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRHQ9HD43 1115 aa29.66■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 GIT1Q9Y2X7 761 aa29.66■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 TBCAO75347 108 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 GALTP07902 379 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 SMTNP53814 917 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 ERVFC1P60507 584 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 PLCB3Q01970 1234 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 SV2BQ7L1I2 683 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 HAUS6Q7Z4H7 955 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 RSPH1Q8WYR4 309 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 STAMQ92783 540 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC19Q96DA6 116 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 ADPGKQ9BRR6 497 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 UBN1Q9NPG3 1134 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 SPG21Q9NZD8 308 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 THEGQ9P2T0 379 aa29.65■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 K7ENM7 598 aa29.64■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 RECQL4O94761 1208 aa29.64■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.347e-7■■■■■ 39.8
TPGS1-201ENST00000359315 TFF2Q03403 129 aa29.64■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 HACE1Q8IYU2 909 aa29.64■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 DHX58Q96C10 678 aa29.64■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 GDAQ9Y2T3 454 aa29.64■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 TRAK2O60296 914 aa29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 PROZP22891 400 aa29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 NMT1P30419 496 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 PPM1AP35813 382 aa29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 UBE3AQ05086 875 aa29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF568Q3ZCX4 644 aa29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB33Q86T24 672 aa29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 SFR1Q86XK3 245 aa29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 TLR9Q9NR96 1032 aa29.63■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 REV3LO60673 3130 aa29.62■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa29.62■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 HYAL1Q12794 435 aa29.62■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 STRN3Q13033 797 aa29.62■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 RESP18Q5W5W9 173 aa29.62■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 COLGALT2Q8IYK4 626 aa29.62■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 KANSL3Q9P2N6 904 aa29.62■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 CACNG4Q9UBN1 327 aa29.62■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa29.62■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 F8W810 466 aa29.61■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 PTGESO14684 152 aa29.61■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 FSCN2O14926 492 aa29.61■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 HARSP12081 509 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 KRT85P78386 507 aa29.61■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 DSC1Q08554 894 aa29.61■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 VN1R3Q9BXE9 311 aa29.61■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 HAPLN2Q9GZV7 340 aa29.61■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 LZTS1Q9Y250 596 aa29.61■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 FAM178BQ8IXR5 827 aa29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 KCNN1Q92952 543 aa29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 IGSF21Q96ID5 467 aa29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA32Q96LK8 384 aa29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 MARCH5Q9NX47 278 aa29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 KCNG1Q9UIX4 513 aa29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 NRP1O14786 923 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 OSTNP61366 133 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 SEZ6Q53EL9 994 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 PLPP4Q5VZY2 271 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 MPZL3Q6UWV2 235 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 RABGGTAQ92696 567 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM169Q96HH4 297 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 RPS6KC1Q96S38 1066 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 TCF25Q9BQ70 676 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM175Q9BSA9 504 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 TBX20Q9UMR3 447 aa29.59■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 LINC01565O15544 149 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
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TPGS1-201ENST00000359315 KRT17Q04695 432 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 GRIK3Q13003 919 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 GLRA4Q5JXX5 417 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 ZPBP2Q6X784 338 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 HLA-CQ95604 372 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 TCHPQ9BT92 498 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 IKZF4Q9H2S9 585 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 GDPD2Q9HCC8 539 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 KBTBD4Q9NVX7 518 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D7Q9P0N9 293 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa29.58■■■□□ 2.33
TPGS1-201ENST00000359315 H0YCG3 227 aa29.57■■■□□ 2.32
TPGS1-201ENST00000359315 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
TPGS1-201ENST00000359315 TOM1L1O75674 476 aa29.57■■■□□ 2.32
TPGS1-201ENST00000359315 MCF2P10911 925 aa29.57■■■□□ 2.32
TPGS1-201ENST00000359315 IDEP14735 1019 aa29.57■■■□□ 2.32
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