RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 LAMA3Q16787 3333 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 TBKBP1A7MCY6 615 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 RHOBTB3O94955 611 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 PNOCQ13519 176 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 GLB1LQ6UWU2 654 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 AGMOQ6ZNB7 445 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 SYCP3Q8IZU3 236 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF507Q8TCN5 953 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 LRCH3Q96II8 777 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 CASD1Q96PB1 797 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 GSDMAQ96QA5 445 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 RSAD1Q9HA92 442 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 SLC39A2Q9NP94 309 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 RNF19AQ9NV58 838 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 GIT1Q9Y2X7 761 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 HES2Q9Y543 173 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 TRIP11Q15643 1979 aa29.3■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 CITO14578 2027 aa29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 COL4A6Q14031 1691 aa29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 MCL1Q07820 350 aa29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 CLLU1OSQ5K130 101 aa29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB33Q86T24 672 aa29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 HELQQ8TDG4 1101 aa29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 CDT1Q9H211 546 aa29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa29.29■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 LCHNA4D1U4 455 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 ABLIM1O14639 778 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 OFD1O75665 1012 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 APOL6Q9BWW8 343 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 RNF39Q9H2S5 420 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 RMND1Q9NWS8 449 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 KANSL3Q9P2N6 904 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 PARP2Q9UGN5 583 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 UBE4BO95155 1302 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 NLRC5Q86WI3 1866 aa29.28■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 LINC01553A4QN01 128 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 MEIS3P2A8K0S8 358 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 GATMP50440 423 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 KCNA1Q09470 495 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 KYAT1Q16773 422 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 PPP2R2DQ66LE6 453 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA20Q8TB22 786 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 SMARCE1Q969G3 411 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 STYXL1Q9Y6J8 313 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa29.27■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 AKAP5P24588 427 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 GRM5P41594 1212 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 TAP1Q03518 808 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 STK4Q13043 487 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 NOMO2Q5JPE7 1267 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 GLIS3Q8NEA6 775 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 URGCPQ8TCY9 931 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF576Q9H609 170 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 SNTG2Q9NY99 539 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 RWDD3Q9Y3V2 267 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa29.26■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0B4J269 797 aa29.25■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD63C9JTQ0 380 aa29.25■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 KIF20AO95235 890 aa29.25■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF697Q5TEC3 545 aa29.25■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 SCFD1Q8WVM8 642 aa29.25■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 SAMD11Q96NU1 681 aa29.25■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ARL5CA6NH57 179 aa29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 INPPL1O15357 1258 aa29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 YARSP54577 528 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 BMT2Q1RMZ1 405 aa29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 SLC39A4Q6P5W5 647 aa29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 THNSL1Q8IYQ7 743 aa29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC43Q8N309 656 aa29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ACAP3Q96P50 834 aa29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 GBP3Q9H0R5 595 aa29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 GDAQ9Y2T3 454 aa29.24■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 OGTO15294 1046 aa29.23■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 HARSP12081 509 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0895Q8NCT3 520 aa29.23■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 POMGNT1Q8WZA1 660 aa29.23■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 GAD1Q99259 594 aa29.23■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 MSTO1Q9BUK6 570 aa29.23■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 HAPLN2Q9GZV7 340 aa29.23■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa29.23■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms