RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317221.11

ZNF559-201, Transcript of zinc finger protein 559, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZNF559, Length 2,732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559-201ENST00000317221 TSPY2A6NKD2 308 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 MAGEB2O15479 319 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CYTH3O43739 400 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 KRT36O76013 467 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 TTC4O95801 387 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 GYS1P13807 737 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CCNFP41002 786 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 INHBCP55103 352 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CDR2Q01850 454 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 AP1B1Q10567 949 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 COASYQ13057 564 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CALCOCO2Q13137 446 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 LSAMPQ13449 338 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 MOGSQ13724 837 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 NEK8Q86SG6 692 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 TBCKQ8TEA7 893 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 RFFLQ8WZ73 363 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 POTEFA5A3E0 1075 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 SMCO2A6NFE2 343 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 GSC2O15499 205 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 MAP3K7O43318 606 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC22O60826 627 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 GFPT2O94808 682 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 PSMG1O95456 288 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 POTEIP0CG38 1075 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 POTEJP0CG39 1038 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ETS2P15036 469 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CTNNA2P26232 953 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ABCD1P33897 745 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 DEUP1Q05D60 604 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 MTA1Q13330 715 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 LIN52Q52LA3 116 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 KRT79Q5XKE5 535 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 GJB7Q6PEY0 223 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF365Q70YC5 407 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 PNMA1Q8ND90 353 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 SPOCK2Q92563 424 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 HAPLN3Q96S86 360 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 MIPEPQ99797 713 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 AAASQ9NRG9 546 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 A0A1W2PRG0 241 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 POTEMA6NI47 508 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 RASA4BC9J798 803 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 RASA4O43374 803 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 PDE8AO60658 829 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ATP6V1G1O75348 118 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 TTLL1O95922 423 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 TMEM253P0C7T8 217 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 HSPA6P17066 643 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 NR2F2P24468 414 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ANXA13P27216 316 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 STAT1P42224 750 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 RTP1P59025 263 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 BPIFB4P59827 614 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 USP46P62068 366 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 CALCRLQ16602 461 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 ECM1Q16610 540 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 GSTA3Q16772 222 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF559-201ENST00000317221 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms