RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 ZFP42Q96MM3 310 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC9B-201ENST00000311308 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC9B-201ENST00000311308 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC9B-201ENST00000311308 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC9B-201ENST00000311308 FZD8Q9H461 694 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC9B-201ENST00000311308 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC9B-201ENST00000311308 ADH1AP07327 375 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 EPCAMP16422 314 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 AKAP5P24588 427 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 GRIK3Q13003 919 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 KIFAP3Q92845 792 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 FBXL18Q96ME1 805 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 POMKQ9H5K3 350 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 MARCH5Q9NX47 278 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM221A6NGB7 291 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 M0R296 226 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PRKCBP05771 671 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 GLUD2P49448 558 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PTGDRQ13258 359 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PTPN21Q16825 1174 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 KRT79Q5XKE5 535 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 ACKR2O00590 384 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 C2CD2LO14523 706 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 CLCN4P51793 760 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 EFNA5P52803 228 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 NBR1Q14596 966 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 MCTP1Q6DN14 999 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 MIOSQ9NXC5 875 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 DNM3Q9UQ16 869 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 LILRB3O75022 631 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 LIG1P18858 919 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 KLK14Q9P0G3 267 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 USTQ9Y2C2 406 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 H3BQV1 296 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 TADA2AO75478 443 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PRPHP41219 470 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 MCM2P49736 904 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 BSNDQ8WZ55 320 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 CDH22Q9UJ99 828 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 GLUD1P00367 558 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 WEE2P0C1S8 567 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 DSG1Q02413 1049 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 CREMQ03060 361 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 MTMR3Q13615 1198 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 ECM1Q16610 540 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 USP41Q3LFD5 358 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 FUT10Q6P4F1 479 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 GPR149Q86SP6 731 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 GPR65Q8IYL9 337 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC9B-201ENST00000311308 THP07101 528 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 TUSC3Q13454 348 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 TMX3Q96JJ7 454 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 SNTG2Q9NY99 539 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 K7ERI5 159 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 TEX28O15482 410 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 RECQL4O94761 1208 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 C1RP00736 705 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TTC9B-201ENST00000311308 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms