RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 KANK3Q6NY19 840 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-201ENST00000309641 SPATA20Q8TB22 786 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-201ENST00000309641 HELQQ8TDG4 1101 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-201ENST00000309641 ZFP42Q96MM3 310 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-201ENST00000309641 YME1L1Q96TA2 773 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-201ENST00000309641 RAD9AQ99638 391 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-201ENST00000309641 TCHPQ9BT92 498 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-201ENST00000309641 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.97□□□□□ -0.81
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PDE4D-201ENST00000309641 PIGRP01833 764 aa9.96□□□□□ -0.81
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PDE4D-201ENST00000309641 ZPBP2Q6X784 338 aa9.96□□□□□ -0.81
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PDE4D-201ENST00000309641 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
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PDE4D-201ENST00000309641 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.96□□□□□ -0.81
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PDE4D-201ENST00000309641 H0YCG3 227 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 BIN1O00499 593 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CLDN3O15551 220 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TGFB1I1O43294 461 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 EOMESO95936 686 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 STAG3L1P0CL83 205 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 BMP6P22004 513 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MLH1P40692 756 aa9.95□□□□□ -0.82
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PDE4D-201ENST00000309641 MCL1Q07820 350 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 KCNB1Q14721 858 aa9.95□□□□□ -0.82
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PDE4D-201ENST00000309641 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ACCSQ96QU6 501 aa9.95□□□□□ -0.82
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PDE4D-201ENST00000309641 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 LINC01553A4QN01 128 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 FAM189A1O60320 539 aa9.95□□□□□ -0.82
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PDE4D-201ENST00000309641 RECQL4O94761 1208 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ITGA4P13612 1032 aa9.95□□□□□ -0.82
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PDE4D-201ENST00000309641 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 21.3
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PDE4D-201ENST00000309641 TAP1Q03518 808 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SMARCE1Q969G3 411 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RSAD1Q9HA92 442 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PARP2Q9UGN5 583 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 INSL6Q9Y581 213 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TRIP11Q15643 1979 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0B4J269 797 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ARL5CA6NH57 179 aa9.94□□□□□ -0.82
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PDE4D-201ENST00000309641 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 HVCN1Q96D96 273 aa9.94□□□□□ -0.82
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PDE4D-201ENST00000309641 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.94□□□□□ -0.82
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PDE4D-201ENST00000309641 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PTGESO14684 152 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 DDHD2O94830 711 aa9.94□□□□□ -0.82
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