RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 NFKBIAP25963 317 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ATL2Q8NHH9 583 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 GCNAQ96QF7 691 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CHP1Q99653 195 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SUFUQ9UMX1 484 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNA4P22459 653 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 PCYT1AP49585 367 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 DAB2P98082 770 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 AGR3Q8TD06 166 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ENO1P06733 434 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL3P08590 195 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC1A1P43005 524 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 RBBP7Q16576 425 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CCT8L2Q96SF2 557 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 GUCY1A2P33402 732 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 EFHC2Q5JST6 749 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 GABBR1Q9UBS5 961 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 E5RI56 91 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SNAP23O00161 211 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 LBRQ14739 615 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 DDIASQ8IXT1 998 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CATSPER1Q8NEC5 780 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 APOL1O14791 398 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ELF1P32519 619 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 LONP2Q86WA8 852 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF135Q8IUD6 432 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC2Q8NEN0 867 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM51Q9BSJ1 452 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 HPCAL4Q9UM19 191 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF2O75151 1096 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 RANBP1P43487 201 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXW10Q5XX13 1052 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 NME3Q13232 169 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 MDH1BQ5I0G3 518 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.56■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP26A1O43174 497 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH6P55285 790 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 KDSRQ06136 332 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX12Q9BXU0 123 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF1BO60333 1816 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CPDO75976 1380 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 TMCC1O94876 653 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 IL10P22301 178 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 IL17RAQ96F46 866 aa25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMC5P62195 406 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC18A3Q16572 532 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35G2Q8TBE7 412 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ADORA2BP29275 332 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 PALLDQ8WX93 1383 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8RI6L899 631 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXP2O15409 715 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SCN4BQ8IWT1 228 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 PDXKO00764 312 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SRGNP10124 158 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 LONRF1Q17RB8 773 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT4P19013 534 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.54■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms